1、要建立與完善管理機制、建設程序：中小型農田水利工程的內容比較廣泛，要實行科學、統(tǒng)一管理，并合理規(guī)劃布局及完善建設程序，要按照先申請規(guī)劃審批，再建設施工，驗收交付使用的原則，使農村小型水利工程建設不斷規(guī)范有序地發(fā)展。

2、嚴格設計資質認證制度與工程招投標制度：嚴格設計資質證制度，要依據(jù)審批工程的規(guī)模，保證聘請擁有一定設計資質的及從事相應水利工程的設計單位設計。審批的全部小型水利工程，要經水行政主管部門招標辦招標。招標辦組織建設單位與有施工準入證的三家以上企業(yè)或單位，依據(jù)設計工程項目進行投標，落實工程招投標制度，以及引進競爭機制與規(guī)范施工管理，明確工程投資，阻止工程建設中腐敗現(xiàn)象發(fā)生，簽訂公證合同才可進入施工程序。

3、建立農田水利工程建設質量保證體系：要加強農田水利工程建設的質量監(jiān)督，并通過業(yè)主自身的質量監(jiān)督等保證工程建設質量。建立質量事故責任追究制度與實行工程質量終身負責制。強化縣級水利部門的技術服務與積極鼓勵社會中介機構投入、參與農田水利的建設，以提供技術指導與服務。

4、建立竣工驗收備案制度與實行獎懲嚴格制度：建設單位在工程竣工后要以竣工報告形式報請示上級水行政主管部門進行驗收。與此同時施工單位也要上報經甲乙雙方共同簽字蓋章的施工保證資料與必備資料，以及匯總的真實完整資料一律備案。市、縣水務局依據(jù)竣工報告與施工資料，組織有關設計、質監(jiān)及相關單位的技術人員和建設單位與施工單位，對工程全面進行驗收，并通過聽取報告、查詢資料及檢測實體與細查局部的程序對所建工程驗收，做出對該工程的綜合評定意見，所有未經過驗收的工程不可交付使用以及結算工程款項。